变异是死亡细胞中极其重要的一类增益，玩家可以在休息室后方，和无名吉兰对话获取，在不进行自定义修改的情况下，整局游戏中玩家至多可以保留三个变异。变异属性分为暴虐，战略和生存，当玩家在后续获取对应属性的卷轴时，还能增强这些变异的效果。

除此之外，游戏内还有一类通用变异，它们大多不受卷轴数量的影响，唯有少部分会基于人物当前三属性中顶尖的那一栏产生变化。武器大师和死而复生都是开始始的通用变异，无需图纸就可以直接解开，前者可以在人物武器产生暴击后，减少其技能的冷却时刻，但要注意的是，这个效果存在着一定的内置冷却，无法不间断触发。后者则是能在人物死亡时，立刻令其复活。

但要注意的是，该效果仅能生效一次，而且只能在第壹个休息室内旋转，后续即便重置变异也不能将其丢弃。成功击败六次看守者之后，玩家将会解开通用变异，弹药，它可以使玩家全部需要消耗弹药的武器，储备弹药数翻倍。成功击败飞咬虫后，有小概率获取冻伤图纸，解开后，它能让陷入减速情形的敌人在后续持续受到伤害，减速效果越严重，伤害数值越高，冰冻情形下的敌人直接受到满层伤害。

成功击败六次时光守护者之后，玩家将能获取通用变异，紧急治疗，它会降低药品的回复数值，但大幅度进步喝药的速度，同时在喝完之后，立刻令人物获取两秒的无人能敌，打boss时特别好用。在第七次击败看守者之后，玩家可以获取变异疏离，它能令人物获取的诅咒层数直接增加50%，但每成功消除一层诅咒，都能立刻为自身回复5%的生活值。